종교시설 신축 목적으로 토지를 매수해 취득세를 면제받은 뒤, 인접 토지 소유자의 반대로 허가를 받지 못하자 매도인과 매매계약을 합의해제하고 소유권이전등기를 말소함.

【심급】 1심 【세목】 취득세 【주문】 1. 피고가 2017. 8. 19. 원고에게 한 63,589,680원의 취득세 등 부과처분을 취소한다. 2. 소송비용은 피고가 부담한다. 【이유】 1. 처분의 경위 가. 원고는 2015. 8. 10. ****(이하 ‘****’라고 한다)로부터 **** 임야 3,528㎡(이하 ‘이 사건 토지’라고 한다)를 매수하면서, ‘건축허가 불가시에는 이 계약은 무효이다’라는 특약을 하였고, 2016. 5. 17. 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 소유권이전등기를 마쳤다. 나. 원고는 종교시설을 신축하기 위하여 이 사건 토지를 취득하였음을 이유로 피고에게 이 사건 토지에 관한 지방세 감면신청을 하여 2016. 5. 23. 지방세특례제한법 제50조 제1항에 따라 취득세 등을 면제받았다. 다. 그 후 원고는 2016. 10. 17. 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 마쳐졌던 소유권이전등기를 합의해제를 원인으로 하여 말소하였고, 2016. 12. 30. ****와 사이에 **** 외 4필지의 토지 면적 합계 3,372㎡를 매매목적물로 하는 내용의 부동산매매변경계약을 체결하였다. 라. 피고는 2017. 8. 19. 원고에게, 원고가 이 사건 토지를 정당한 사유 없이 취득일로부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니하고, 해당 용도로 직접 사용한 기간이 2년 미만인 상태에서 이를 매각·증여하거나 다른 용도로 사용하는 것으로 확인되었다는 이유로, 당초 비과세하였던 취득세 56,443,200원, 농어촌특별세 2,382,160원 및 지방교육세 4,764,320원 합계 63,589,680원을 부과·고지(이하 ‘이 사건 처분’이라고 한다)하였다. 마. 원고는 이 사건 처분에 불복하여 조세심판원에 심판청구를 하였으나, 조세심판원은 2018. 3. 26. 원고의 위 심판청구를 기각하였다. [인정 근거] 다툼 없는 사실, 갑 제1 내지 3, 9호증, 을 제1 내지 4, 9호증의 각 기재, 변론 전체의 취지 2. 관련 법령 별지 관련 법령 기재와 같다. 3. 원고 주장의 요지 원고는 이 사건 토지에 교회건물을 신축할 목적으로 이 사건 토지를 매수하였고, 교회건물의 진입로를 확보하기 위하여 피고에게 도로지정변경허가신청서 등을 제출하였으나, 피고로부터 위 허가를 받기 위해서는 이 사건 토지와 인접한 토지 소유자의 토지사용승낙서가 필요하다는 답변을 들었다. 이에 따라 원고는 **** 토지의 소유자인 ****으로부터 토지사용승낙서를 받기 위하여 노력하였으나, 위 종중의 반대로 인하여 위 허가를 받는 것이 불가능하게 되었다. 따라서 원고와 **** 사이에 이 사건 토지에 관하여 체결된 매매계약은 특약에 따라 무효가 되었고, 그에 따라 관련 세무상 효과도 소급하여 발생하지 않았던 것으로 되어야 할 것이며, 지방세특례제한법 제50조 제1항에 규정된 유예기간이 끝나기 전에 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 마쳐졌던 소유권이전등기가 말소되었으므로, 원고는 이 사건 토지에 관한 취득세의 과세대상이 되는 이 사건 토지를 취득한 것으로 볼 수 없다. 더 나아가, 원고가 이 사건 토지를 교회건물을 신축하는 데 사용하지 못한 이유는 인접한 토지의 소유자로부터 토지사용승낙을 받지 못하여 도로지정변경허가의 요건을 갖추는 것이 불가능하게 되었기 때문이므로, 이는 지방세특례제한법 제50조 제1항 단서 제2호 소정의 정당한 사유가 있는 경우에 해당한다. 4. 판단 가. 지방세특례제한법 제50조 제1항 제2호 해당 여부 1) 지방세특례제한법 제50조 제1항은 종교단체가 종교행위를 목적으로 하는 사업에 직접 사용하기 위하여 취득하는 부동산에 대해서는 취득세를 면제한다고 규정하고 있고, 같은 항 단서 제2호는 정당한 사유 없이 그 취득일부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니하는 경우 그 해당 부분에 대해서는 면제된 취득세를 추징한다고 규정하고 있는바, 위 규정의 추징사유인 ‘취득일로부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니하는 경우’에는 부동산에 관한 소유권이전등기를 마침으로써 이를 취득한 후 그 매매계약이 해제되어 이를 당해 사업에 사용하지 아니하게 된 경우도 포함된다고 봄이 상당하다(대법원 2006. 2. 9. 선고 2005두4212 판결 참조). 그러므로 살피건대, 원고가 ****로부터 이 사건 토지를 매수하고, 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 소유권이전등기를 마침으로써 이를 취득한 후, 이 사건 토지를 종교행위를 목적으로 하는 사업에 사용하지 않은 사실, 원고와 **** 사이에 이 사건 토지에 관하여 체결된 매매계약이 합의해제 된 사실은 당사자 사이에 다툼이 없거나, 앞서 인정한 바와 같으므로, 원고가 이 사건 토지에 관한 매매계약을 해제하고, 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 마친 소유권이전등기를 말소한 것은 지방세특례제한법 제50조 제1항 제2호 소정의 ‘그 취득일부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니하는 경우’에 해당한다. 2) 다음으로, 원고가 이 사건 토지를 그 취득일부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니한 데에 정당한 사유가 있는지 여부에 관하여 살피건대, 종교단체가 종교행위를 목적으로 하는 사업에 사용하기 위하여 부동산을 취득하였다가 그 부동산에 관한 계약이 합의해제 등으로 지방세특례제한법 제50조 제1항 단서 소정의 유예기간 내에 당해 부동산에 관한 등기까지 말소하였다면 당해 부동산을 해당 목적에 직접 사용하여야 할 세법상의 의무가 소멸하므로 그 해당 목적에 직접 사용하지 못한 데 정당한 사유가 있어 등록세를 부과할 수 없다고 할 것인바(대법원 2013. 6. 28. 선고 2013두2778 판결 참조), 원고가 2016. 5. 17. 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 소유권이전등기를 마쳤다가, 그로부터 3년이 경과하기 이전인 2016. 10. 17. 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 마쳐졌던 소유권이전등기를 합의해제를 원인으로 하여 말소한 사실은 앞서 인정한 바와 같으므로, 이에 따라 원고가 이 사건 토지를 종교행위를 목적으로 하는 사업에 직접 사용할 세법상 의무는 소멸하였고, 원고가 이 사건 토지를 위와 같은 목적으로 직접 사용하지 못한 데에는 정당한 사유가 있다고 봄이 상당하다. 3) 따라서 원고에게 지방세특례제한법 제50조 제1항 제2호의 추징사유가 있다고 볼 수 없다. 나. 지방세특례제한법 제50조 제1항 제3호 해당 여부 원고가 ****와 사이에 이 사건 토지에 관하여 체결된 매매계약을 합의해제하고, 그에 따라 이 사건 토지에 관하여 원고 명의로 마쳐졌던 소유권이전등기를 합의해제를 원인으로 하여 말소한 사실은 앞서 인정한 바와 같은데, 지방세특례제한법 제50조 제1항 제3호는 부동산을 취득한 후 해당 용도로 직접 사용한 기간이 2년 미만인 상태에서 이를 매각·증여하거나 다른 용도로 사용하는 경우에는 면제된 취득세를 추징한다고 규정하고 있고, 조세법률주의의 원칙상 과세요건이거나 비과세요건 또는 조세감면요건을 막론하고 조세법규의 해석은 특별한 사정이 없는 한 법문대로 해석할 것이고 합리적 이유 없이 확장해석하거나 유추해석하는 것은 허용되지 아니하므로(대법원 2003. 1. 24. 선고 2002두9537 판결 등 참조), 원고가 이 사건 토지에 관하여 체결된 매매계약을 합의해제 한 것이 ‘취득한 부동산을 매각·증여하거나 다른 용도로 사용하는 경우’에 해당한다고 볼 수 없어, 결국 원고에게 지방세특례제한법 제50조 제1항 제3호의 추징사유가 있다고 볼 수도 없다. 5. 결론 그렇다면, 원고의 이 사건 청구는 이유 있으므로 이를 인용하기로 하여, 주문과 같이 판결한다. 별지 ※ 관련법령 ○ 지방세특례제한법 제50조(종교단체 또는 향교에 대한 면제) ① 종교단체 또는 향교가 종교행위 또는 제사를 목적으로 하는 사업에 직접 사용하기 위하여 취득하는 부동산에 대해서는 취득세를 면제한다. 다만, 다음 각 호의 어느 하나에 해당하는 경우 그 해당 부분에 대해서는 면제된 취득세를 추징한다. 1. 해당 부동산을 취득한 날부터 5년 이내에 수익사업에 사용하는 경우 2. 정당한 사유 없이 그 취득일부터 3년이 경과할 때까지 해당 용도로 직접 사용하지 아니하는 경우 3. 해당 용도로 직접 사용한 기간이 2년 미만인 상태에서 매각·증여하거나 다른 용도로 사용하는 경우. 끝.